Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP4Q969E2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP4Q969E2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms