Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BAP1Q92560 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BAP1Q92560 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BAP1Q92560 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms