Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CASKIN1Q8WXD9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CASKIN1Q8WXD9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CASKIN1Q8WXD9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CASKIN1Q8WXD9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CASKIN1Q8WXD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CASKIN1Q8WXD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CASKIN1Q8WXD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms