Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY2Q8WXA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RUFY2Q8WXA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY2Q8WXA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms