Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKA2Q8WVK7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms