Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG1Q8WTW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG1Q8WTW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms