Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HELQQ8TDG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELQQ8TDG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELQQ8TDG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms