Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCER1Q8TC90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER1Q8TC90 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCER1Q8TC90 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms