Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYRIPQ8NFW9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYRIPQ8NFW9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYRIPQ8NFW9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms