Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIEQ8NEW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIEQ8NEW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIEQ8NEW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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