Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC9Q8NEP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHDC9Q8NEP7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms