Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP2Q8ND30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms