Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF169Q8NCN4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF169Q8NCN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF169Q8NCN4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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