Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH13Q8NBN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH13Q8NBN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms