Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COLGALT1Q8NBJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COLGALT1Q8NBJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms