Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC29Q8NA56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC29Q8NA56 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms