Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTD1Q8N815 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTD1Q8N815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTD1Q8N815 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms