Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MINDY1Q8N5J2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MINDY1Q8N5J2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MINDY1Q8N5J2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms