Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC43Q8N309 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC43Q8N309 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC43Q8N309 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms