Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLASRPQ8N2M8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLASRPQ8N2M8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms