Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLGN4XQ8N0W4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLGN4XQ8N0W4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN4XQ8N0W4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms