Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC8AQ8IWT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC8AQ8IWT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC8AQ8IWT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms