Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HAPLN4Q86UW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HAPLN4Q86UW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms