Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
YTHDF3Q7Z739 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YTHDF3Q7Z739 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms