Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC29A4Q7RTT9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC29A4Q7RTT9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms