Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST3Q7LGC8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST3Q7LGC8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms