Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms