Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PREX2Q70Z35 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PREX2Q70Z35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PREX2Q70Z35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms