Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP34Q70CQ2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP34Q70CQ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP34Q70CQ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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