Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA1549LQ6ZVL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms