Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM179Q6ZVK1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM179Q6ZVK1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM179Q6ZVK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms