Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00173Q6ZV60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms