Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC149Q6ZUS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC149Q6ZUS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms