Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPGS1Q6ZTW0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPGS1Q6ZTW0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms