Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC141Q6ZP82 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC141Q6ZP82 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms