Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELC1Q6UW63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELC1Q6UW63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms