Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP20A1Q6UW02 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms