Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUX4L9Q6RFH8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DUX4L9Q6RFH8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms