Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L2Q6R6M4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L2Q6R6M4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP17L2Q6R6M4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms