Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q6P435 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q6P435 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q6P435 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q6P435 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q6P435 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q6P435 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q6P435 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6P435 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q6P435 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q6P435 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms