Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3CQ6NXT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms