Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRGCQ6NXR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRGCQ6NXR0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRGCQ6NXR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms