Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB12Q6IQ22 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms