Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USPL1Q5W0Q7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms