Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECM29Q5VYK3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ECM29Q5VYK3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms