Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCERG1LQ5VWI1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCERG1LQ5VWI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms