Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF20Q5VTR2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF20Q5VTR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF20Q5VTR2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms