Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF17Q5VTA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF17Q5VTA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms