Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAGI3Q5TCQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MAGI3Q5TCQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MAGI3Q5TCQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms