Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDLRAD1Q5T700 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LDLRAD1Q5T700 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LDLRAD1Q5T700 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms